Na conversie van een bestand naar een andere bestandsextensie kan je andere programma's gebruiken om het te bedienen. Houd er echter rekening mee dat een GRAPHMLZ-bestand na conversie naar GRAPHML enigszins van het origineel kan afwijken, al was het maar in de lay-out van de gegevens. De belangrijkste informatie blijft gewoonlijk bewaard, maar als je wilt dat het bestand na conversie van GRAPHMLZ naar GRAPHML identiek blijft, moet je overdacht te werk gaan en de gewenste applicatie kiezen uit de onderstaande lijst. Er is natuurlijk geen garantie dat de conversie 100% volgens je verwachtingen zal verlopen, maar ze zal zeker helpen. Indien het effect van de conversie van een bestand van GRAPHMLZ naar GRAPHML niet aan je verwachtingen voldoet, kan je gewoon proberen om op het internet een andere versie van je bestand in het formaat GRAPHMLZ te vinden, dat al eerder door een andere persoon correct naar een GRAPHML-bestand is omgezet. Als dat niet werkt, gebruik dan de informatie die je verder op de website vindt.
Helaas, indien je na de twee eerder beschreven stappen (poging om je eigen GRAPHMLZ- bestand te vinden, dat door een andere persoon is omgezet, en poging van zelf te converteren naar het formaat GRAPHML), nog steeds een probleem hebt met je bestand, dan zijn er niet veel oplossingen meer. Je kan nogmaals proberen om een applicatie te vinden en te installeren, die in staat is het GRAPHMLZ-bestand in het originele formaat te openen (zonder conversie naar een GRAPHML-bestand). Een dergelijke oplossing zal moeilijk uit te voeren zijn, maar het zal zeker het beste resultaat opleveren.